Đối tượng áp dụng của Thông tư là Tổng Cục thuế thuộc Bộ Tài Chính; Cục Quản lý đăng ký kinh doanh thuộc Bộ Kế hoạch và Đầu tư; Cục thuế, Chi Cục thuế; Phòng đăng ký kinh doanh thuộc Sở Kế hoạch và Đầu tư các tỉnh, thành phố trực thuộc Trung ương. Các đơn vị này cũng là đầu mối trao đổi thông tin.

Các thông tin trao đổi bao gồm: Hệ thống danh mục dùng chung; thông tin đăng ký thành lập doanh nghiệp, đăng ký hoạt động đơn vị trực thuộc; thông tin đăng ký thay đổi nội dung đăng ký doanh nghiệp, nội dung đăng ký hoạt động đơn vị trực thuộc; thông tin về tình hình hoạt động của doanh nghiệp, đơn vị trực thuộc; thông tin về việc vi phạm pháp luật về thuế của người thành lập, quản lý doanh nghiệp; thông tin về báo cáo tài chính của doanh nghiệp.

Ngoài ra, Thông tư còn quy định quy trình trao đổi thông tin đăng ký thành lập doanh nghiệp, đăng ký hoạt động đơn vị trực thuộc; trao đổi thông thông tin đăng ký thay đổi nội dung đăng ký doanh nghiệp, nội dung đăng ký hoạt động đơn vị trực thuộc; trao đổi thông tin đăng ký tạm ngừng kinh doanh; trao đổi thông tin đăng ký giải thể doanh nghiệp, chấm dứt hoạt động đơn vị trực thuộc của doanh nghiệp; trao đổi thông tin thu hồi Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, Giấy chứng nhận đăng ký hoạt động đơn vị trực thuộc.

Thông tư 01/2016/TTLT-BKHĐT-BTC có hiệu lực thi hành kể từ ngày 15/4/2016.